明尼苏达大学的旗舰校区是“双城校区”，该校区位于圣保罗和明尼阿波利斯，后者分为密西西比河东岸和西岸。作为明尼苏达大学系统中五个校园中最大的一个，双城校园拥有50,000多名学生;这使它成为美国整体第六大校园学生团体。它还拥有300多个研究，教育和推广中心和研究所，涉及从生命科学到公共政策和技术的所有领域。该大学提供143个本科学位课程和200个研究生学位课程。该大学拥有后备军官训练团的所有三个分支。
明尼阿波利斯原始校园俯瞰密西西比河上的圣安东尼瀑布，但后来又向下游移动了大约一英里到当前位置。如今，该大学的明尼阿波利斯校园被密西西比河分为东西两岸。校园现在在两个河岸上都有建筑物。东岸是校园的主要部分，占地307英亩。西岸是明尼苏达大学法学院，汉弗莱公共事务学院，卡尔森管理学院，各种社会科学建筑和表演艺术中心的所在地。为了帮助简化大型校园的导航，该大学将东岸划分为几个区域：诺尔区，购物中心区，健康区，运动区和门户区。
医疗卫生方面是购物中心区东南部，专注于为本科建筑物生物科学的学生，以及学院的家药房，学院的护理，在牙科学校的医学院，在公共学校Health and M Health Fairview 医院和诊所。这种建筑群构成了明尼苏达大学医学中心。该地区设有部分生物科学学院。
明尼苏达大学医学中心Fairview街对面是一个被称为“超级街区”的区域，这是一个由四个市政厅(先锋，边境，百年纪念馆和领地馆)组成的四个城市街区。超级街区是校园住宿最受欢迎的地点之一，因为它是学生在校园中集中度最高的地方，并且在宿舍之间有许多社交活动。
圣保罗校区位于Falcon Heights市，距明尼阿波利斯校区约3英里。服务于校园的邮政编码的默认地名是“圣保罗”，但所有校园建筑的街道地址中也可以识别“猎鹰高地”。在食品，农业和自然资源科学学院，包括明尼苏达州食品工业中心的大学和社会科学的许多其他学科的职业教育，是在这个校园。它还包括继续与专业研究学院，兽医学院，和生物科学学院。
广阔的草坪，花草树木和周围的大学研究农场用地创造了一个更绿色，更安静的校园。它拥有自己的绿草如茵的购物中心，可以从更城市的明尼阿波利斯校园中撤退一点。该校区的主要景点是贝利厅，这是圣保罗校区唯一的宿舍。校园连接巴士在工作日的工作日每5分钟运行一次，周末每20分钟运行一次，使学生可以轻松访问这两个校园。
