约翰霍普金斯大学和卫生系统的科学家们对SARS-CoV-2(引起COVID-19的病毒)的基因组进行测序的努力进行了这样一项关于“COVID-19病毒早期引入国家首都地区特征”的研究。
约翰霍普金斯大学APL分子生物学家彼得·蒂伦(Peter Thielen),为3月下旬在约翰霍普金斯医院的分子诊断实验室准备了一种手持式DNA测序仪。
蒂伦和跨企业团队致力于对SARS-CoV-2基因组进行测序,从而开展了一项研究,该研究的特征是将该病毒早期引入国家首都地区。(供图:Johns Hopkins APL / Ed Whitman)
研究指出,该病毒多次进入该区域,但临床表现相似,这表明尽管遗传差异很小,但循环病毒很可能引起相同的疾病。不仅如此,该研究还提供了有关实施检疫程序时病例进展的信息,以及研究最终疫苗效力的方法。
这项研究由约翰霍普金斯大学应用物理实验室分子生物学家工作发起,并使用部分在马里兰州劳雷尔市APL开发的软件和方法。该研究由JHU COVID-19研究响应计划资助,该计划为快速响应团队提供种子资金,以在COVID-19大流行中寻找解决方案并增加知识。
Johns Hopkins卫生系统在马里兰州诊断出超过37%的早期COVID-19病例,这些病例来自居住在巴尔的摩-华盛顿都会区的患者。对114份诊断出的阳性样品的基因组进行了测序,并对这些患者的疾病表现和结果进行了分析。
通过分析,研究小组观察到可能将SARS-CoV-2病毒多次引入该地区以及许多没有旅行或病史的患者,表明该地区在3月初已建立了社区传播途径。他们没有检测到病毒遗传变异与患者预后之间有明显的联系,例如:医院或重症监护病房(ICU)的入院-这意味着他们发现病毒的家谱与患者感染的严重程度之间可能没有联系。
那么,为什么这项研究是由约翰霍普金斯大学发起?这与其常年保持下来的诸多“第一”是分不开的。接下来,彬彬就来为您揭秘那些你不知道的,由约翰霍普金斯大学常年保持的“第一”,看看它到底有多强悍吧。
众所周知,约翰霍普金斯大学属于美国私立大学,而美国的私立大学中绝大部分经费来源于校友捐赠。约翰霍普金斯大学也不能免俗,它是美国第一所靠巨额捐赠办起来的学校,在当时的美国,那可是有史以来最大的一笔慈善捐赠。它还是西半球第一所研究型大学,至今保持着科研经费全美第一(也可能是世界第一),真的是有钱到壕!
有了丰厚的家底,约翰霍普金斯大学才有可能折腾起超过75年历史的约翰霍普金斯大学应用物理实验室(APL)。这个实验室为系统工程和集成、技术研发及分析方面都做出了重大的贡献。
APL:全美最大的大学附属研究中心,它是约翰霍普金斯大学附属研究中心是独立的非营利组织,从事必要的研究、开发和系统工程,以支持美国国家安全需求。
从APL走出来的科学家、工程师、分析员,都是美国政府最值得信赖的顾问和技术专家,因为其能够确保维护美国国家安全并推进太空前沿的复杂技术的可靠性。
不仅如此,APL还维持着独立的研发计划,用以开拓和探索新兴技术和概念来解决未来的国家优先事项。所以,这项关于“COVID-19病毒早期引入国家首都地区特征”的研究由APL发起,也就是顺理成章的事了。